Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms