Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q99KU6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q99KU6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q99KU6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms