Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hps4Q99KG7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hps4Q99KG7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hps4Q99KG7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hps4Q99KG7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hps4Q99KG7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hps4Q99KG7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hps4Q99KG7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hps4Q99KG7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hps4Q99KG7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms