Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Slc8b1Q925Q3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Slc8b1Q925Q3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc8b1Q925Q3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc8b1Q925Q3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms