Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim59Q922Y2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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