Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crb1Q8VHS2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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