Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms