Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rdh10Q8VCH7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms