Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssh3Q8K330 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssh3Q8K330 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms