Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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FgbQ8K0E8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FgbQ8K0E8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
FgbQ8K0E8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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