Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Pkn3Q8K045 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkn3Q8K045 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms