Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Znf628Q8CJ78 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Znf628Q8CJ78 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf628Q8CJ78 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf628Q8CJ78 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf628Q8CJ78 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf628Q8CJ78 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf628Q8CJ78 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf628Q8CJ78 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf628Q8CJ78 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf628Q8CJ78 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf628Q8CJ78 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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