Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc43a2Q8CGA3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc43a2Q8CGA3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms