Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG19

Ltbp1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp1Q8CG19 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ltbp1Q8CG19 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ltbp1Q8CG19 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ltbp1Q8CG19 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ltbp1Q8CG19 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ltbp1Q8CG19 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ltbp1Q8CG19 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ltbp1Q8CG19 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms