Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms