Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Bcas3Q8CCN5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bcas3Q8CCN5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms