Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Samd4aQ8CBY1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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