Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrbnQ8C7D2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrbnQ8C7D2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms