Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms