Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek11Q8C0Q4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms