Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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