Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms