Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Atg4bQ8BGE6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Atg4bQ8BGE6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Atg4bQ8BGE6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Atg4bQ8BGE6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Atg4bQ8BGE6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atg4bQ8BGE6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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