Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms