Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms