Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atp8b3Q6UQ17 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms