Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms