Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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