Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Msl2Q69ZF8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms