Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pkp4Q68FH0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Pkp4Q68FH0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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