Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno1Q689Z5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms