Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tfe3Q64092 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tfe3Q64092 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tfe3Q64092 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tfe3Q64092 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tfe3Q64092 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tfe3Q64092 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tfe3Q64092 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tfe3Q64092 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tfe3Q64092 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms