Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms