Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms