Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf3Q60765 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf3Q60765 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf3Q60765 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf3Q60765 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms