Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms