Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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