Protein–RNA interactions for Protein: Q501J6

Ddx17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx17Q501J6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx17Q501J6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx17Q501J6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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