Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trp53i11Q4QQM4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trp53i11Q4QQM4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trp53i11Q4QQM4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms