Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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Krtap9-3Q3V2C1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Krtap9-3Q3V2C1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms