Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms