Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ankrd27Q3UMR0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ankrd27Q3UMR0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ankrd27Q3UMR0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ankrd27Q3UMR0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ankrd27Q3UMR0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ankrd27Q3UMR0 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms