Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Arfgef3Q3UGY8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Arfgef3Q3UGY8 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Arfgef3Q3UGY8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms