Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms