Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q3U1D9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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