Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms