Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ccndbp1Q3TVC7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ccndbp1Q3TVC7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ccndbp1Q3TVC7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ccndbp1Q3TVC7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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