Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tamm41Q3TUH1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tamm41Q3TUH1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tamm41Q3TUH1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tamm41Q3TUH1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tamm41Q3TUH1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tamm41Q3TUH1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms