Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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