Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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